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Proteine und ihre Struktur

Ein rohes Ei wird in der Pfanne weiß und fest — dabei ist keine einzige Peptidbindung gebrochen.

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Die Peptidbindung

  • Anknüpfung:Aminosäuren (6.2.1) verknüpfen sich wie die Monomere eines Polyamids (6.1.4): Carboxygruppe + Aminogruppe → Amidbindung + Wasser.
  • Peptidbindung:die Amidbindung –CO–NH– zwischen zwei Aminosäuren.
Merke

Bildung eines Dipeptids: \(\ce{H2N-CHR^1-COOH}\) \(\ce{+ H2N-CHR^2-COOH}\) \(\ce{->}\) \(\ce{H2N-CHR^1-CO}\)\(\ce{-NH-CHR^2-COOH}\) \(\ce{+ H2O}\)

  • Planar:das freie Elektronenpaar des N ist mit der C=O-Gruppe mesomer verteilt (5.4.2) — die C–N-Bindung hat Doppelbindungsanteil und ist nicht frei drehbar.
  • Leserichtung:vom N-Terminus (freie \(\ce{NH3+}\)-Gruppe) zum C-Terminus (freie \(\ce{COO-}\)-Gruppe): Gly–Ala ≠ Ala–Gly.
  • Größen:Dipeptid, Oligopeptid (bis ca. 10), Polypeptid; ab etwa 100 Aminosäuren spricht man von Proteinen.
  • Primärstruktur:die Aminosäuresequenz — bei 20 Aminosäuren gibt es \(20^n\) mögliche Sequenzen der Länge \(n\).
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Vier Strukturebenen

  • Sekundärstruktur:Wasserstoffbrücken zwischen C=O und N–H des Rückgrats: α-Helix (Brücke von Baustein \(i\) zu \(i+4\), 3,6 Bausteine pro Windung) oder β-Faltblatt (nebeneinanderliegende Stränge).
  • Tertiärstruktur:räumliche Faltung der ganzen Kette durch Wechselwirkungen der Seitenketten: Disulfidbrücken (kovalent), Ionenbindungen, Wasserstoffbrücken, hydrophobe Wechselwirkungen.
  • Quartärstruktur:mehrere Polypeptidketten lagern sich zusammen, z. B. Hämoglobin aus vier Untereinheiten.

Die Kette ist ein Undecapeptid. Klicke den Baustein an, an dem die Kette zu einer Haarnadel umklappen soll (oder Tab, ←/→ und Enter). Finde die Stelle, an der sich möglichst viele Seitenketten gegenseitig binden — und erhitze dann das Peptid.

Kette umklappen, Bindungen finden

Halte fest: Die Wasserstoffbrücken zwischen den Peptidgruppen des Rückgrats bilden die Sekundärstruktur, die Wechselwirkungen der Seitenketten die Tertiärstruktur. Beim Erhitzen bleiben nur kovalente Bindungen — Peptid- und Disulfidbindungen — erhalten.

  • Denaturierung:Hitze, starke Säuren oder Basen, Schwermetallionen oder Ethanol zerstören Sekundär- bis Quartärstruktur; die Primärstruktur bleibt. Meist irreversibel — das Protein verliert seine Funktion.
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Allgemeine Hinweise

Denaturierung ist keine Hydrolyse

Beim Erhitzen entfaltet sich das Protein nur. Die Peptidbindungen spalten erst Enzyme oder kochende Salzsäure über viele Stunden.

Welche Wasserstoffbrücke?

Brücken zwischen C=O und N–H des Rückgrats gehören zur Sekundärstruktur, Brücken zwischen Seitenketten (z. B. Ser–Thr) zur Tertiärstruktur.

Peptide lesen

Immer links mit dem N-Terminus beginnen und die Dreibuchstaben-Codes mit Bindestrichen verbinden: Val–Ser–Glu ist ein anderes Peptid als Glu–Ser–Val.

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