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Übung AFB II

Vom Retinoblastom bis zum siRNA-Medikament — erst den Zusammenhang finden, dann die Lösung.

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Aufgabenblock — AFB II

Zehn Aufgaben, in denen Wissen aus mehreren Unterkapiteln zusammenkommt: Befunde erklären, Daten deuten, Mutationen einordnen. Drei gestufte Tipps helfen beim Ansatz.

A1
Drei Arten, Nucleinsäure zu synthetisieren
AFB II

Vergleichen Sie Replikation, Transkription und PCR, indem Sie in jeder Zeile genau ein Kreuz setzen.

Setzen Sie in jeder Zeile das passende Kreuz — hier ist es genau eins pro Zeile. Enter setzt und löscht.
MerkmalReplikationTranskriptionPCR
Der Primer wird von der Primase aus RNA gebildet.
Die Stränge werden durch Hitze getrennt.
Kein Primer ist nötig.
Uracil wird eingebaut.
Nur ein gewählter kurzer Abschnitt wird vervielfältigt.
Am Folgestrang entstehen Okazaki-Fragmente.
Das Produkt wird bei Eukaryoten noch im Kern bearbeitet.
Replikation und PCR brauchen Primer, die Transkription nicht. Die PCR ersetzt die Helicase durch Hitze und nutzt künstliche DNA-Primer für einen gewählten Abschnitt. Nur die Transkription baut Uracil ein; ihr Produkt, die Prä-mRNA, wird prozessiert.
Überlegen Sie zu jedem Vorgang: Wer trennt die Stränge, wer liefert das 3′-Ende?
Die PCR ahmt die Replikation im Reagenzglas nach — aber ohne Helicase und Primase.
Replikation: Primase-Primer, Okazaki · Transkription: ohne Primer, Uracil, Prozessierung · PCR: Hitze, gewählter Abschnitt.
Lösung anzeigen
Alle drei Vorgänge synthetisieren komplementär in 5′→3′-Richtung. Replikation und PCR brauchen dazu Primer mit freiem 3′-Ende — in der Zelle RNA-Primer der Primase, in der PCR künstliche DNA-Primer, die nur einen gewählten Abschnitt einrahmen. Die PCR trennt die Stränge durch Hitze statt mit der Helicase. Die RNA-Polymerase der Transkription startet ohne Primer am Promotor, baut Uracil ein und liefert bei Eukaryoten eine Prä-mRNA, die im Kern prozessiert wird.
A2
Retinoblastom in zwei Formen
AFB II
Material: Retinoblastom (Netzhauttumor)

Erbliche Form: meist in den ersten Lebensmonaten, oft mehrere Tumoren in beiden Augen. Sporadische Form: meist erst nach dem ersten Lebensjahr, fast immer nur ein Tumor in einem Auge. Ursache sind in beiden Fällen Mutationen im Gen RB.

Erklären Sie die Unterschiede zwischen beiden Formen: Markieren Sie alle zutreffenden Aussagen.

Mehrere Antworten können richtig sein. Markieren Sie alle zutreffenden und klicken Sie dann auf „Prüfen“.
Two-hit-Hypothese (KNUDSON): Das Tumorsuppressorgen RB fällt erst aus, wenn beide Allele defekt sind. Wer ein defektes Allel erbt, braucht nur noch einen somatischen Treffer — viel wahrscheinlicher, also früher und oft beidseitig.
RB ist ein Tumorsuppressorgen — wie viele Allele müssen ausfallen?
Vergleichen Sie, wie viele Mutationen in einer Zelle neu entstehen müssen: erblich eine, sporadisch zwei.
Drei Aussagen stimmen: ein geerbter Treffer, viele Zellen → beidseitig, sporadisch beide Treffer in einer Zelle.
Lösung anzeigen
RB ist ein Tumorsuppressorgen; die Teilungsbremse fällt erst aus, wenn beide Allele defekt sind. Bei der erblichen Form bringt jede Zelle bereits einen defekten Treffer mit, ein einziger weiterer somatischer Treffer genügt. Da die Netzhaut sehr viele Zellen enthält, trifft das früh und in mehreren Zellen ein — mehrere Tumoren, oft beidseitig. Bei der sporadischen Form müssen beide Mutationen zufällig in derselben Zelle entstehen; das ist unwahrscheinlich, deshalb tritt der Tumor später und meist nur einmal auf.
A3
Ein siRNA-Medikament wirkt
AFB II
Material: Patisiran

Bei der erblichen Transthyretin-Amyloidose bilden Leberzellen ein fehlgefaltetes Protein (TTR), das sich in Nerven und Herz ablagert. Das Medikament Patisiran enthält eine siRNA, deren einer Strang komplementär zur TTR-mRNA ist. Es wird alle drei Wochen als Infusion gegeben.

Erläutern Sie die Wirkung, indem Sie den Gedankengang Schritt für Schritt aufbauen.

Spielen Sie den Gedankengang Schritt für Schritt durch: Was ist jetzt richtig? Nur die richtige Karte bringt Sie weiter.
    siRNA → RISC → Passagierstrang entfernt → Leitstrang paart mit TTR-mRNA → Schnitt durch Argonaute → weniger Protein. Die DNA bleibt unverändert; die Wirkung lässt nach, wenn keine siRNA mehr in der Zelle ist.
    RNA-Interferenz wirkt posttranskriptionell im Cytoplasma.
    Nur der Leitstrang bleibt im RISC — er findet die komplementäre mRNA.
    RISC → Leitstrang → Paarung mit mRNA → Schnitt → weniger Protein, Gen unverändert.
    Lösung anzeigen
    Die siRNA wird im Cytoplasma vom RISC aufgenommen; der Passagierstrang wird entfernt. Der verbleibende Leitstrang paart komplementär mit der TTR-mRNA, und das Enzym Argonaute zerschneidet sie. Ohne intakte mRNA bilden die Ribosomen kaum noch TTR, die Ablagerungen nehmen ab. Das TTR-Gen selbst bleibt unverändert — es handelt sich um einen Knock-down, der nur anhält, solange siRNA vorhanden ist. Deshalb sind regelmäßige Infusionen nötig.
    A4
    Das Riesengen Dystrophin
    AFB II
    Material: Dystrophin (Modellwerte)

    Das Gen für das Muskelprotein Dystrophin ist mit 2 200 000 bp eines der längsten Gene des Menschen. Die reife mRNA ist 14 000 Nucleotide lang, das Protein besteht aus 3685 Aminosäuren. Die RNA-Polymerase verlängert die RNA um 40 Nucleotide pro Sekunde, ein Ribosom baut 6 Aminosäuren pro Sekunde ein.

    Ermitteln Sie Schritt für Schritt die Dauer der Transkription, den Anteil der Prä-mRNA, der in der reifen mRNA übrig bleibt, die Länge des codierenden Abschnitts und die Dauer der Translation.

    Rechnen Sie die Kette Schritt für Schritt: Erst wenn ein Schritt stimmt, wird der nächste freigeschaltet. Enter prüft. Dezimalzahlen mit Komma oder Punkt.
    1. Dauer der Transkription (auf eine Dezimale) h
    2. Anteil der reifen mRNA an der Prä-mRNA (auf zwei Dezimalen) %
    3. Nucleotide der Codons einschließlich Stoppcodon nt
    4. Dauer der Translation eines Proteins (auf eine Dezimale) min
    2 200 000 nt : 40 nt/s = 55 000 s ≈ 15,3 h · 14 000 : 2 200 000 ≈ 0,64 % · (3685 + 1) · 3 = 11 058 nt · 3685 : 6 s ≈ 614 s ≈ 10,2 min. Über 99 % der Prä-mRNA sind Introns; die Transkription dauert viel länger als die Translation.
    Die Prä-mRNA ist so lang wie das ganze Gen — Introns werden mit transkribiert.
    Rechnen Sie Sekunden in Stunden bzw. Minuten um; beim codierenden Abschnitt zählt das Stoppcodon mit.
    55 000 s · 0,64 % · 3686 Codons · 614 s.
    Lösung anzeigen
    Transkription: 2 200 000 nt : 40 nt/s = 55 000 s ≈ 15,3 h. Die reife mRNA macht nur 14 000 : 2 200 000 ≈ 0,64 % der Prä-mRNA aus — der Rest sind Introns, die beim Spleißen entfernt werden. Codierender Abschnitt: 3685 Codons + 1 Stoppcodon = 3686 Codons, also 11 058 Nucleotide; der Rest der reifen mRNA sind nicht übersetzte Bereiche und der Poly-A-Schwanz. Translation: 3685 : 6 s ≈ 614 s ≈ 10,2 min.
    A5
    Ein Hemmstoff der Deacetylase
    AFB II
    Material: Zellkultur mit HDAC-Hemmstoff (Modellwerte)

    Zellen werden 24 h mit einem Hemmstoff der Histon-Deacetylase (HDAC) behandelt, Kontrollzellen ohne. Gemessen am Promotor von Gen X:

    Anteil acetylierter Histone: Kontrolle 15 %, Hemmstoff 60 % · mRNA von Gen X: Hemmstoff 5-mal so viel wie Kontrolle · DNA-Methylierung des Promotors: in beiden Gruppen 20 %

    Deuten Sie die Messwerte: Entscheiden Sie bei jeder Deutung, ob sie stimmt.

    5 Aussagen nacheinander. Eine falsche Einschätzung reicht — dann starten Sie die Serie mit „Neue Runde“ neu.
    Aussage 1 von 5

    Acetylierung neutralisiert die positiven Ladungen der Histonschwänze → lockeres Euchromatin → mehr Transkription. Der Hemmstoff wirkt nur auf diese Ebene; Methylierung und Basensequenz bleiben unverändert.
    Was macht eine Deacetylase — und was passiert, wenn sie ausfällt?
    Vergleichen Sie alle drei Messgrößen: Welche ändert sich, welche nicht?
    Drei Deutungen stimmen: Acetylgruppen bleiben, Chromatin lockerer, deacetylierte Histone binden fest.
    Lösung anzeigen
    Der Hemmstoff blockiert die Deacetylase, deshalb bleiben mehr Acetylgruppen an den Histonen (15 % → 60 %). Die Acetylgruppen neutralisieren die positive Ladung der Histonschwänze, die negativ geladene DNA wird lockerer gebunden, am Promotor entsteht Euchromatin. RNA-Polymerase und Transkriptionsfaktoren binden leichter; Gen X wird stärker transkribiert (5-fache mRNA). Da die DNA-Methylierung unverändert bleibt, erklärt sie den Anstieg nicht; die Basensequenz ist ohnehin nicht betroffen.
    A6
    Eine Familie mit Mukoviszidose
    AFB II
    Material: Stammbaum

    In dieser Familie tritt Mukoviszidose auf.

    I-1I-2II-1II-2II-3II-4IIIerkrankt

    Werten Sie den Stammbaum aus, indem Sie jede Angabe festlegen.

    Wählen Sie in jedem Menü den passenden Eintrag. Alle Felder müssen stimmen.
    FrageIhre Auswertung
    Erbgang
    Genotyp von I-2
    Genotyp von II-3
    Genotyp von II-4
    Wahrscheinlichkeit, dass II-4 Anlageträger ist
    Gesunde Eltern mit erkrankten Kindern → rezessiv. Die erkrankte Tochter II-3 hat einen gesunden Vater → X-chromosomal-rezessiv ist ausgeschlossen. Beide Eltern sind Aa; der gesunde Sohn II-4 ist AA oder Aa im Verhältnis 1 : 2.
    Zwei gesunde Eltern haben erkrankte Kinder — was folgt daraus für die Dominanz?
    Eine erkrankte Frau mit gesundem Vater schließt einen X-chromosomalen Erbgang aus.
    Autosomal-rezessiv · I-2: Aa · II-3: aa · II-4: AA oder Aa, Anlageträger mit 2/3.
    Lösung anzeigen
    Die gesunden Eltern I-1 und I-2 haben zwei erkrankte Kinder — das Allel ist rezessiv, beide Eltern sind heterozygote Anlageträger (Aa). Da die erkrankte Tochter II-3 einen gesunden Vater hat, ist ein X-chromosomal-rezessiver Erbgang ausgeschlossen: Der Erbgang ist autosomal-rezessiv. Die Erkrankten II-2 und II-3 sind aa. Der gesunde Sohn II-4 ist AA oder Aa; unter den gesunden Kindern zweier Anlageträger treten AA und Aa im Verhältnis 1 : 2 auf, also ist er mit der Wahrscheinlichkeit 2/3 Anlageträger.
    A7
    Warum drei Basen je Codon?
    AFB II

    Leiten Sie her, wie lang ein Codon mindestens sein muss, damit vier Basen 20 Aminosäuren und ein Stoppsignal verschlüsseln können. Tragen Sie die Zwischenergebnisse ein.

    Füllen Sie alle Felder aus und prüfen Sie dann. Enter in einem Feld prüft ebenfalls. Dezimalzahlen mit Komma oder Punkt.
    ÜberlegungWert
    Zahl der möglichen Codons aus 1 Base
    Zahl der möglichen Codons aus 2 Basen
    Zahl der möglichen Codons aus 3 Basen
    Mindestlänge eines Codons in Basen
    Zahl der Codons, die im Standardcode für Aminosäuren stehen
    4¹ = 4 und 4² = 16 reichen nicht für 20 Aminosäuren, erst 4³ = 64. Von den 64 Codons sind 3 Stoppcodons, 61 codieren Aminosäuren — daher ist der Code degeneriert.
    An jeder Position eines Codons kann eine von vier Basen stehen.
    Die Zahl der Kombinationen ist 4 hoch Codonlänge.
    4 · 16 · 64 · Länge 3 · 64 − 3 = 61.
    Lösung anzeigen
    Mit n Basen je Codon gibt es 4ⁿ verschiedene Codons: 4 bei n = 1, 16 bei n = 2 — beides weniger als die 21 nötigen Bedeutungen (20 Aminosäuren + Stopp). Erst n = 3 liefert 64 Codons, also mindestens drei Basen. Weil 64 Codons nur 21 Bedeutungen tragen, codieren viele Aminosäuren durch mehrere Codons: Im Standardcode stehen 61 Codons für Aminosäuren und 3 für Stopp.
    A8
    Vier Arten von Genmutationen
    AFB II
    Material: Ausschnitt einer mRNA

    Wildtyp: 5′-AUG GCU UGG CAA CUU GAA…-3′ → Met – Ala – Trp – Gln – Leu – Glu …

    Ordnen Sie jede Veränderung der mRNA ein.

    Ziehen Sie jede Karte in den passenden Korb — oder wählen Sie sie mit Enter aus und drücken Sie dann die Ziffer des Korbs (1, 2, 3, 4; 0 legt sie zurück).
    1stumm
    2Missense
    3Nonsense
    4Rastermutation
    GCA = Ala, GAG = Glu (stumm) · CCU = Pro statt Leu, ACU = Thr statt Ala (Missense) · UGA und UAA = Stopp (Nonsense) · Verlust oder Einfügen einer Base verschiebt das Leseraster.
    Übersetzen Sie jedes neue Codon mit der Code-Sonne und vergleichen Sie mit der ursprünglichen Aminosäure.
    Stoppcodons sind UAA, UAG und UGA.
    Je zwei: stumm (GCA, GAG), Missense (CCU, ACU), Nonsense (UGA, UAA), Raster (Deletion, Insertion).
    Lösung anzeigen
    Stumm: GCU → GCA (beide Ala) und GAA → GAG (beide Glu) — möglich, weil der Code degeneriert ist. Missense: CUU → CCU ersetzt Leu durch Pro, GCU → ACU Ala durch Thr. Nonsense: UGG → UGA und CAA → UAA erzeugen Stoppcodons, das Protein bricht nach Ala bzw. Trp ab. Rastermutation: Verlust oder Einfügen einer einzelnen Base verschiebt das Leseraster ab dieser Stelle.
    A9
    Okazaki-Fragmente zählen
    AFB II

    Chromosom 1 des Menschen enthält rund 250 Millionen Basenpaare. Okazaki-Fragmente sind beim Menschen etwa 200 Nucleotide lang. Schätzen Sie ab, wie viele Okazaki-Fragmente bei einer Replikation dieses Chromosoms insgesamt entstehen.

    Ziehen Sie den Regler auf Ihren Schätzwert und klicken Sie dann auf „Schätzung prüfen“ — mit der Tastatur verstellen ←/→ den Regler.
    0 Mio.5 Mio.
    Beide Elternstränge werden kopiert, zusammen 500 Mio. neue Nucleotide. An jeder Replikationsgabel entsteht einer der beiden neuen Stränge als Folgestrang — insgesamt also die Hälfte: 250 Mio. Nucleotide : 200 ≈ 1,25 Mio. Fragmente.
    An jeder Replikationsgabel wird ein neuer Strang durchgehend, der andere in Stücken gebildet.
    Neu synthetisiert werden 2 · 250 Mio. Nucleotide — welcher Anteil davon ist Folgestrang?
    ½ · 500 Mio. nt : 200 nt ≈ 1,25 Mio.
    Lösung anzeigen
    Bei der Replikation entstehen zwei neue Stränge von je 250 Mio. Nucleotiden, zusammen 500 Mio. An jeder der vielen Replikationsgabeln wird ein neuer Strang als Leitstrang, der andere als Folgestrang gebildet, insgesamt ist also die Hälfte der neuen DNA — 250 Mio. Nucleotide — Folgestrang. Bei 200 Nucleotiden je Fragment sind das rund 1,25 Millionen Okazaki-Fragmente, die alle einen Primer brauchen und von der Ligase verknüpft werden.
    A10
    Wie ein stummes Gen stumm bleibt
    AFB II

    Lea soll begründen, warum ein Gen, das in einer Leberzelle stumm ist, auch in ihren Tochterzellen stumm bleibt. Begründen Sie den Sachverhalt korrekt, indem Sie die fehlerhaften Schritte ihrer Begründung markieren.

    In dieser Begründung stecken Fehler. Klicken Sie genau die falschen Zeilen an — die richtigen müssen stehen bleiben.
    Methylierung ändert die Genaktivität, nicht die Basenfolge. Nach der semikonservativen Replikation kopieren Methyltransferasen das Muster vom alten auf den neuen Strang — so erben Tochterzellen den Aktivitätszustand.
    Epigenetische Veränderungen betreffen nicht die Basensequenz.
    Nach der Replikation ist der neue Strang zunächst unmethyliert — bleibt es dabei?
    Zwei Zeilen sind falsch: Zeile 2 und Zeile 5.
    Lösung anzeigen
    Im Promotor des stummen Gens sind CpG-Stellen methyliert; die Basenfolge ändert sich dabei nicht. Transkriptionsfaktoren und RNA-Polymerase binden schlechter, das Gen wird nicht transkribiert. Bei der semikonservativen Replikation erhält jede Tochter-DNA einen alten, methylierten und einen neuen Strang. DNA-Methyltransferasen erkennen die halbmethylierten CpG-Stellen und methylieren den neuen Strang nach. So erben die Tochterzellen das Methylierungsmuster, und das Gen bleibt stumm.